病毒变异的主要原因可从病毒生存机制、形态结构性质以及病毒复制机制方面进行分析。
1、病毒生存机制：病毒本身并没有自主生存的能力，需要寄生在其他生物的活细胞中，从而存活下来。所以为了适应多种环境，病毒需要通过不断变异来得到繁殖、生存的机会。
2、形态结构性质：病毒需要在体内进行复制，而病毒属于单链RNA，单链结构不稳定，所以容易发生变异的情况。
3、病毒复制机制：在细胞内复制时，利用人体内特定的酶进行入侵，这种酶难以纠正该外来病毒，而在人体进行RNA复制过程中，错误地复制大量RNA病毒并且产生变异。