打掉孩子对身体的伤害比较大，包括术中和术后的并发症。术中的并发症包括出血，子宫穿孔，人工流产综合征，漏吸或空吸，吸宫不全，感染及羊水栓塞等；术后远期并发症包括宫颈粘连，宫腔粘连，慢性盆腔炎，月经失调及继发不孕等。
1、术中并发症。妊娠月份比较大时，出血量多，如果子宫收缩不好，甚至引发术中大出血。尤其有过剖宫产的女性，要特别小心疤痕部位的妊娠，如果术前没有仔细检查，人流时引发的大出血可能危及生命。子宫本身情况异常或手术操作不当可能引起子宫穿孔。手术刺激宫颈局部神经引起术中恶心呕吐，心动过缓，血压下降等人流综合征的表现，需要及时采取措施，最严重可导致呼吸心跳骤停。
手术过程没有彻底清除胚胎绒毛等妊娠组织物时，出现漏吸，空吸或者吸宫不全，子宫会因为宫腔残留而出现大出血，或者阴道反复不规则出血；如果合并感染可能引发痛经和下腹部及腰酸背痛等症状。最罕见的是羊水栓塞，但是这也是最紧急最致命的。
2、术后远期并发症。可能导致出现内分泌失调、月经紊乱甚至闭经、月经量少及下还有反复终止妊娠，改变内分泌轴的规律，可能引起月经紊乱。手术过程对子宫粘膜造成一定损伤，容易产生子宫内膜修复不好，宫腔粘连，严重时导致不孕不育。复发性流产。多次流产容易造成子宫口扩张，宫腔环境改变如宫腔粘连等，怀孕后导致复发性流产。炎症感染导致急慢性盆腔炎，引起不孕和疼痛可能。
孕期越短，打掉孩子后对身体的影响相对更小，但同时建议夫妻同房时要做好避孕措施，减少人流的可能性。