脑干血栓最好的情况是能完全恢复，但只在很少数的患者。
脑干血栓是指椎-基底动脉及其分支血管出现狭窄或闭塞而引起的脑干（脑干包括中脑、脑桥和延髓三部分）缺血，从而出现相应的神经系统症状和体征，严重者常可危及生命。
如果脑干血栓发现早，血栓较小，治疗规范及时，最好的情况是能使血栓减小直至消失。
脑干血栓急性期的治疗包括缓解脑水肿、改善微循环、溶栓、抗凝、扩血管等措施来改善脑缺血区的血液循环、促进神经功能恢复。恢复期继续加强瘫痪肢体功能锻炼和言语功能训练，除药物外，可配合使用康复理疗。此外，可服用抗血小板聚集剂，如潘生丁或阿司匹林等，有助于防止再发。