三个月婴儿由于其免疫系统发育尚不成熟，机体抵抗力较低，容易引起病毒或细菌等感染，从而导致咳嗽，咳痰等症状。宝宝有痰吐不出的情况，可以考虑和宝宝还比较小，机体的反应能力比较差等原因有关。宝宝咳嗽有痰症状，一般多考虑是因为炎症刺激呼吸道黏膜引发的临床表现，属于呼吸道感染症状。
建议积极带宝宝去正规医院儿科就诊，请医生确诊病因后进行对因对症治疗。治疗期间可以让宝宝吸入一些温热的水蒸气，或者通过多喝水等方法来稀释痰液，促进痰液排出。另外在宝宝咳嗽的时候，可以轻轻地拍打宝宝的背部，通过震动有助于促进痰液从气管壁上脱落，痰液多会随着咳嗽或者大便排出体外。