丙酸杆菌什么药可以根治不能一概而论，需要根据具体情况判断。丙酸杆菌属于革兰阳性厌氧杆菌，临床上以痤疮丙酸杆菌较为常见，痤疮丙酸杆菌是寄生在皮肤上的正常菌群，会导致皮肤出现青春痘，治疗用药主要有以下几种：
1、外用药：临床用药包括红霉素软膏、过氧苯甲酰凝胶等，能有效抑制细菌繁殖，如局部出现化脓，可选用龙珠软膏。必要时可以联合维A酸类的药物进行治疗，能起到改善油脂分泌的作用。
2、口服药：主要给予抗生素治疗，例如红霉素、多西环素等，能迅速控制炎症，有助于消灭细菌；或选用具有清热活血功效的中药进行调理，如黄芩、丹参、黄连等。