真菌感染的话，可分为表浅的真菌感染和深部真菌感染两大类，表浅感染是由藓菌侵犯皮肤，毛发，指甲等皮表的部位造成的发病率高危害性小。
深部真菌感染，是由念珠菌和隐球菌侵犯内脏器官及深部组织造成的发病率低但危害大，抗真菌的药。目前的话，根据作用机制，大致可分为三种。
第一个的话，作用于真菌细胞膜中甾醇合成的抗真菌药物，包括氟康唑等米唑类药物，多烯类药物两性霉素等，以及稀丙胺类药物特比萘芬。
第二个作用于真菌细胞壁合成的抗真菌药物，如棘白菌素类的卡泊芬净，其抑制真菌细胞壁主要成分的1,3葡聚糖的合成以及抑制几丁质合成的日光霉素和多氧霉素等。
第三个作用于核酸合成的抗真菌药物，如五氟尿嘧啶等。