空腹跑步是会影响患者的消化道器官的。空腹跑步会增加胃肠道的负担，会影响患者身体的各个脏器，特别是肝脏和胆囊，是会容易出现负担加重，从而诱发胃肠功能紊乱。空腹跑步还会诱发心脑血管疾病的发生，有的患者甚至会出现脑血栓，心梗等疾病发生，特别是一些老年人，如果空腹跑步，胃中没有食物消耗，在运动过程中主要消耗脂肪，脂肪被分解之后就会变成很多的游离的脂肪酸，在血管内，是会容易引起心脏和脑血管出现堵塞的情况。
空腹跑步对人体的刺激是比较大的，在跑步运动的时候因大量的出汗，带走了很多的钠钾等离子，从而造成了人体离子失衡的情况发生，特别对于一些体质比较虚弱的人来说是需要格外注意的。