男孩隐睾的原因可能是遗传因素、睾丸发育异常、内分泌因素和解剖结构异常等。
1、遗传因素。隐睾具有较为明显的家族遗传倾向，有家族史人群的隐睾发病率通常比一般人群的发病率高。
2、睾丸发育异常。胚胎期性腺发育异常，会使两侧睾丸融合为一个睾丸，影响睾丸沿正常途径下降；加上本身发育异常缺陷，导致睾丸不能对相应激素产生反应，影响睾丸正常下降，进而形成隐睾。
3、内分泌因素。由于中枢神经系统功能异常，导致睾酮分泌也会异常，就会引起睾丸下降不完全。
4、解剖结构异常。因精索血管过短、鞘状突异常、筋膜覆盖于阴囊入口处、睾丸过大造成机械梗阻等情况，均可引起睾丸下降障碍，造成隐睾。