先天性代谢病能活多久是不能一概而论的，可能就存活几年，也可能存活到老年。
先天性代谢病是统称，包括多种疾病。不同的疾病，其严重程度不同，生存时间也有所不同。另外，先天性代谢病存活时间还与患者的治疗情况相关，若患者规律治疗，严密监测，存活时间会相对较长。
比如苯丙酮尿症，该疾病早期诊断，早期治疗，一般预后较好，存活时间可与常人相当。但若患者未定期检测血苯丙氨酸浓度，容易导致Phe（苯丙氨酸）缺乏症，表现为严重皮肤损害、营养不良、贫血、低蛋白血症等，甚至死亡。
比如异染性脑白质营养不良，该疾病通常呈进行性发展，且目前尚无针对本病的有效治疗方法，因此死亡率较高。婴幼儿时期发病者多可存活2～4年，青春期前后发病者可存活4～6年，成人期发病者可存活10年左右。