在临床上有一类强迫症患者属于难治性的，尽管应用五羟色胺再摄取抑制剂。约30%到40%的患者仍然比较难以治疗，在临床上对于难治性强迫症主要是指两种足够剂量的五羟色胺再摄取抑制剂足疗程治疗以后仍然无效的强迫症患者。
所以说在临床上多种药物治疗仍然效果欠佳，此时应该进行联合药物治疗，包括联合心理治疗，物理治疗等等方法来解决问题。
特别是联合应用两种以上的作用机制不同的抗抑郁药物足量足疗程治疗，同时进行认知行为疗法，森田疗法等等治疗方法，或者是采用重复经颅磁刺激或者是深部脑刺激等方法来帮助强迫症患者进行改善。