本药物主要用来预防同种异体肾、肝、心等 一些排斥反应，另外还用来治疗银屑病、难治性狼疮肾炎等疾病，效果不错。但是，环孢素的副作用也不容忽视，长期使用的话会有肾毒性，这是最为常见的症状，除此之外还会引发高血压等一些不良症状，下面详细介绍。
1、肾毒性，这也是环孢素最主要的副作用。但这种功能性的肾毒性通常不会引起永久性的肾损害，减量或停用后可以恢复。而且环孢素慢性肾毒性与个体的易感性密切相关，就是说不是每个人用了都会出现肾毒性，是因人而异的。所以用药前及用药期间要密切监测肌酐、尿素氮等肾功能相关指标，以及时调整用药。这也是为什么用了药之后，医生反复强调一定要定期复诊，定期检查血常规、肝肾功能的原因。
2、高血压：有一部分患友经环孢素治疗后可发生高血压。发生率在成人与儿童相似，环孢素治疗后导致的高血压大多可以用药物控制。老年患者尤其需要注意，同时患有高血压的患者要慎重用这个药。所以有高血压的患友，需要告知您的医生，让他全面了解您的身体情况，才能更好的安全用药。
3、和其他免疫抑制剂一样，环孢素可增加发生淋巴瘤和其它恶性肿瘤、特别是皮肤癌的风险。而对于淋巴细胞增生性疾病，发现了立即停药是有效的。考虑到皮肤恶性病变的潜在危险，所以服用环孢素治疗的患友应避免过度暴露在紫外线下。
4、还有其他的副作用如恶性肿瘤、多毛、牙龈增生、胃肠道紊乱、感觉异常、震颤或头痛等，但减量或停用环孢素后这些副作用通常可以消失。