肛门指检一般不会疼。正常情况下，肛门松紧度适合，肛门指诊时不会出现疼痛，可能会有一些肛门坠胀及不适感，或者产生想要排便的感觉。肛门指诊是一种基本的肛门检查方法，能够明确肛门是否有压痛、肿物以及直肠末端是否有硬结、肿块、新生物等，还可以检查肛门的大小、松紧度等。
肛门指检疼吗
1、只要患者放轻松，肛门指检一般不会有疼痛的感觉，只会出现轻微不适或下坠感。
2、如果患者本身有肛门疾病，比如肛周脓肿、肛裂、肛门狭窄、血栓性痔等疾病，都会导致肛门疼痛，还会出现轻微的疼痛感。
肛门指检的方法
1、肛门指检可以分为两个部分的检查，肛门指检查和直肠指检查。
2、肛门指检的自检操作：戴上手套后，用食指触摸肛门，感觉一下有无硬结、肿块或压痛，有无波动感，肛门皮肤下有无瘘、绳索的方向等。
3、肛门指检是临床上较为常见的疾病检查方法，主要用于直肠指检，准确率较高。医生会用一个手指头伸进患者的肛门，大致可以确定距肛缘7~10cm的肛门，手指操作，简单易行，无创伤检查，而且费用低廉，患者只会出现轻微不适。