临床上常用的眼药水包括抗微生物类眼药水、人工泪液类、激素类眼药水。这些眼药水均属于药品，其应用应有明确适应症。若长期使用抗生素滴眼液甚至是多种抗生素滴眼液，容易造成菌群失调而继发真菌感染或病毒感染，若长期使用激素类滴眼液，则容易产生激素性青光眼。
一、眼药水使用的误区
1、眼部不适就使用眼药水：长期近距离工作或使用电脑的人，在工作一定时间后出现视疲劳或慢性结膜炎症状，即依赖抗生素眼药水治疗，这是治疗上一个误区。因为长期不合理的用眼往往是产生上述不适感觉的根源，而并非是细菌、病毒等感染所致。
2、眼药水长期频繁使用：目前，无论处方性眼药还是非处方性眼药，只有一二种不含防腐剂成分。防腐剂对眼结膜杯状细胞具有损伤作用，长期使用可能会诱导干眼症的发生。
3、使用眼药水绝对安全：滴眼药水安全无害的想法是根本错误的，长期点用眼药水除了会引起上述提到的干眼症外，还可导致激素性青光眼、非致病菌性角膜炎、结膜炎等，甚至因药液中某些成分导致过敏反应而危及生命。
4、随意选用眼药水：在治疗上要根据不同的症状和发病原因，来选择合适的药物。
5、随意存放眼药水：眼药水应密闭放在阴凉处保存，有条件者可置4℃冰箱保存，并请留意眼药水的保质时间。
二、眼药水对眼睛的副作用
对于长期使用人工泪液的干眼症患者，医生多推荐单支包装的一次性眼药水，这种眼药水是不含防腐剂的，但也比较昂贵。研究表明，眼药水中防腐剂毒性有时比药物还大。