妊娠40天药流是否能流净，需于服药后7~10天到医院进行彩超检查，了解宫腔情况。如果宫腔有异常回声或阴道出血量较大，即药流未干净，需要清宫，如果时间长了容易造成组织机化，导致清宫困难，对下一次妊娠和内膜会造成更大的伤害，因此及时进行清宫术。
药流前做哪些检查
进行B超检查，B超提示宫腔内有妊娠囊，以便进行接下来的手术。否则，如果是宫外孕手术，这样会很麻烦，后果是不可想象的。因此，有必要用B超来提示宫内孕囊的大小和具体位置。
一定要严格查问病史，是否有心血管病史、哮喘史、肝病史、传染病史等。因为药物流产需要肝、肾代谢，所以有一定的药物流产禁忌。哮喘、心脏病患者等不能与药物流产。此外，必须做的事情必须有心电图，异常心电图应禁止使用药物流产，因为这很容易引起心脏突发事件。
其他检查根据所有的手术方式要求做相应的化验，如血常规、肝肾功能、乙型肝炎加丙型肝炎、凝血功能、梅毒、艾滋病检查等。这是一个辅助检查，所有的人都必须做手术。虽然药物流产方便，但在这个过程中可能会有大量出血，不完全的药物流动导致大出血再引起休克的情况是存在的。因此，尽量不要私下用药，必须寻求医生的帮助，以免造成大出血，甚至危及病人的生命。