新生儿肛门闭锁手术费多在3万元左右，具体的手术费用要以实际医院收费准。新生儿肛门闭锁是一种常见的先天性消化系统发育畸形的现象，对新生儿而言具有一定的危险性存在；因此，建议如有发现新生儿有肛门闭锁的情况，要及时进行相应的咒术治疗 ，进一步有效解除肛门闭锁的现象。
新生儿肛门闭锁的原因
肛门闭锁在临床上属于中位畸形，是儿科症状相对常见的一种现象，主要是因原始肛发育障碍，未向内凹入形成肛管，直肠发育基本正常，其盲端在尿道球海绵肌边缘或阴道下端附近，耻骨直肠肌包绕直肠远端，造成会阴发育不良，肛区为完整被皮肤覆盖的现象。
在早期胚胎发育中，胎儿的肛门与直肠没有很好的分开，因直肠与膀胱相连，形成泄殖腔；当胚胎发育到第七周的时候，中胚层会向下生长，将直肠与尿生殖窦进行分开，直肠则会向阴部延伸，尿生殖窦逐渐形成膀胱、尿道、阴道等。
在胚胎发育到第九周时，直肠继续向下伸延，穿过骨盆膜以及肛门膜，与原始肛门相连通，进而形成直肠肛门。在一时期因某些特殊因素，造成骨盆膈膜或肛门膈膜不能与直肠连接贯通，则 会形成肛门先天性闭锁症 。