新生儿上呼吸机后遗症大致分为三种。一是气压性损伤。在使用呼吸机时由于压力过高或持续时间较长。肺泡破裂致不同程度造成气压伤。二是持续的高气道压，尤其高PEEP影响了回心血量，使得心搏击量减少，内脏血流量灌注减少。三是呼吸道感染。气管插管本身可将上气道的细菌、真菌等带至下气道造成感染，或者是污染的吸痰管、器械以及不清洁的手等，均可将病原菌带人下呼吸道。
新生儿什么情况下上呼吸机
1、当脐带血流受阻时，如脐带脱垂、绕颈、打结、压迫、扭转等造成胎儿的供血不足或供血停止从而引起缺氧，使中枢受到了抑制以致宝宝发生窒息。
2、胎盘气体交换障碍，如胎盘功能不全、前置胎盘、胎盘早期剥离、低位胎盘等。
3、胎盘的母体侧面灌流不足，如妊娠高血压、出血、严重贫血、休克以及慢性心、肺、肾疾病或分娩过程中使用麻醉、镇静药物等。
新生儿上呼吸机有后遗症怎么办
1、使用呼吸机会有口干舌燥的症状可以通过使用湿化器，宝宝就不会出现鼻干口燥了，同时恒温湿化器的舒适度要高于湿化器。
2、在睡前使用鼻腔血管收缩剂或用加温湿化器可改善宝宝鼻腔出血的情况，若有鼻息肉，鼻中偏曲需要手术矫正的。