恩替卡韦停药后不一定会反弹。规范用药后停药后大多数不会引起反弹，但是仍有部分会反弹，如果使用药物疗程太短，过早停药，则反弹风险极大。
恩替卡韦是常用的治疗乙肝的药物，因为恩替卡韦可以抑制乙肝病毒的复制，从而能够达到治疗乙肝的效果。并不是所有的乙肝患者都需要使用恩替卡韦治疗，通常在达到了抗病毒治疗的指标，才可以在医生的指导下使用恩替卡韦治疗，恩替卡韦的使用疗程比较久，即使乙肝病毒转阴后，一般也建议继续巩固治疗三年的时间，经过巩固治疗后，并经医生指导规范停药，也有不少患者出现病毒学反弹，因此现在一般不建议患者停药，只有乙肝表面抗原完全转阴才是停药的金指标。每个人反弹情况不一，一般在停药1-3月就会出现病毒学反弹，也有一两年后才反弹，出现病毒学反弹后可能会出现组织学反弹，导致肝功能异常，甚至出现爆发性肝衰竭，严重者可在一月内死亡。因此，停药后一定要定期复查乙肝DNA定量及肝功能。