女性是可以在怀孕期间做亲子鉴定的，孕妇的羊水中含有胎儿的遗传信息，特别是可以提取少量的胎儿绒毛。在做亲子鉴定中，在鉴定时就主要是以抽取腹中羊水的方式来达到目的，然后配合收集的基因仰恩。通过比较分析可以得到是否有亲子关系。
可以在怀孕期间做亲子鉴定吗?答案是肯定的。所采用的方法是利用羊膜穿刺术采集羊水提取胎儿DNA和待测父亲的DNA，以达到亲子鉴定的目的，该鉴定方法的检测结果与胎儿有关。而且准确性是有保障的，产后检查结果一致、准确、可靠。
怀孕期间做亲子鉴定的最佳时间是16~24周之间，这取决于医生对孕妇身体状况的诊断。一般需要3~6毫升的羊水样本。为了避免存储不当，样品必须尽快鉴定，否则结果会不准确。有必要提醒孕妇，羊水必须定期送往医院，并由经验丰富的妇科医生收集，以确保孕妇和胎儿的安全。
值得注意的是，虽然羊膜穿刺术总体上是安全的，但有创拔有可能增加宫内感染，影响胎儿发育。对于一些流产高危因素的孕妇，也有一定的流产危险性。因此，很多需要做亲子鉴定的孕妇会选择去香港做亲子鉴定。香港DNA血检亲子鉴定采用无创抽血法，非常简单，无风险，妊娠8周后即可确诊。准确率超过90%。
传统的胎儿亲子鉴定是一种侵入性检测，虽然目前的技术已经成熟，但也存在一定的风险。建议定期进行胎儿亲子鉴定的孕妇选择前三甲医院。正规的医院都有专业的妇科医生，他们更安全，而且检测设备和经验丰富，可以确保胎儿的正常发育不受影响。