建筑工程系是厦门理工学院重点建设的系部之一，27年的办学培养了大批基础扎实、知识面广、适应能力强的工程建设专业人才。
建筑工程系现有全日制学生620余人，副教授以上职称的教师占专任教师的30.9%，硕博士学历的教师占专任教师的72.1%。目前设置的本科专业有：四年制土木工程、工程管理和五年制建筑学。根据学校“抢抓机遇、主动对接、凝练特色、服务地方”的办学宗旨，建筑工程系在办学方面形成了以下特色：
坚持以教学为中心，以科研和工程实践促教学
建筑工程系形成了一支以中青年教师为主体，年龄、学历、专业职称结构合理、充满活力的教师队伍：专任教师大多具有国家注册结构工程师、注册建筑师、注册建造师、注册造价师或注册监理工程师的从业资格；兼职教授多是在工程建设业界具有崇高威望的技术或管理专家，他们有：厦门市建设与管理局林树枝总工程师（博士、教授级高工）、厦门市造价站王权民站长（博士、高级工程师）、厦门市市政建设指挥部欧阳永金副总工程师（博士、副教授）等。
建筑工程系在教学过程注重加强各种实践性教学环节，重视提高师生的工程实践能力。在抓好教学的同时，成立了建筑设计院、建筑检测和节能技术中心以及建筑经济与项目管理研究所等实体机构，形成了教学、科研、生产实践相结合的教育机制和多层次办学体系。近年来完成了多个工程项目的设计和工程管理、咨询工作，取得了良好的社会和经济效益。
坚持开放式办学、面向社会需求“政产学研”合作办学
建筑工程系注重政产学研结合，集中优质资源办学，积极与企业联办专业，实行订单式培养。“政产学研”合作办学的主要形式有：科技合作、学生实践基地建设、与企业共建实验室、设立企业奖助学金等。目前建筑工程系已与厦门市在建重点工程建设办公室、厦门市造价站、厦门市工程监理协会、厦门象屿工程管理咨询公司等单位建立了长期合作研发关系，正在进行或已经完成的产学研合作项目均取得了良好的社会和经济效益；同时建筑工程系还与兴海湾工程监理公司、员当工程监理公司、天和项目管理公司等10余家知名建筑企业共建学生实训基地，开展学生预就业培养模式试点，使学生在就业前积累必要的工作经验；目前建筑工程系还正与福建三华房地产公司等3家知名房地产商协商设立奖教奖学金。
建筑工程系正着力构筑特色鲜明、配置合理、先进实用的创新实践平台和实验教学体系。其中，实验室总建筑面积近5000平方米，教学实验仪器设备总值超1100万元；力学中心、土工实验中心以及建筑技术实验室获得财政部中央与地方共建实验室专项资助；与厦门市建筑科学研究院合作的建筑检测和节能技术中心是厦门市19个重点实验（工程）中心之一。
坚持厚基础、强过程、重能力，毕业生广受社会青睐
建筑工程系既培养富有创造力的应用型的建筑设计人才，又培养专业化的建筑施工或房地产开发与经营管理人才等应用型人才。专业设置和人才培养模式切合海峡西岸经济区，特别是厦门市跨越式发展中大型建设的需要，就业率多年来一直名列全校前茅，不少毕业生已成为厦门工程建设界的中坚力量：相当数量的系友已成为建筑设计院、监理公司以及施工企业的高管人员，有十数位系友目前为厦门市建设与管理局、厦门市规划局、厦门市国土资源与房产管理局等政府机关的领导班子成员。
建筑工程系的绝大部分毕业生都在厦门市就业，一次性就业率历年均高达92%以上。培养的学生以能务实、敢创新、勤吃苦、动手能力强而深受用人单位欢迎，象屿建设、火炬集团、员当开发、长实监理等一批知名建设企业都是建筑工程系的用人大户。针对04、05、06届建筑工程系毕业生的质量调查表明：在专业知识水平、团队合作能力、分析解决问题的能力、敬业精神、是否愿意继续招聘建筑工程系毕业生和对学生总体印象等10个方面，用人单位反馈评价的优良率均在80%以上。
建筑学专业（本科五年）
【培养目标】
本专业培养适应经济与社会发展，具备坚实的理论基础和扎实的基本功，从事建筑设计、城市设计、风景园林设计及室内设计等工作的应用型高级专门人才。
【主要课程】
建筑设计基础、建筑制图与表达、建筑美术、建筑设计系列课、城市规划、力学与结构、建筑构造、计算机辅助设计、建筑物理、建筑设备等。
【就业方向】
可在工业或民用建筑设计院、城市规划设计院、室内设计公司、园林景观设计公司从事设计工作，或房地产公司从事项目前期策划、投资开发等工作。近年建筑学专业毕业生就业前景好、薪酬待遇高，优秀学生在毕业当年基本被预订。
土木工程专业（本科四年）
本专业设房屋建筑工程和道路桥梁工程两个专业方向
房屋建筑工程方向：
【培养目标】
本专业培养基础扎实、知识面宽、动手能力强、获得工程师基本训练的高级房屋建筑工程技术人才。具有进行房屋建筑工程设计、施工、试验、管理和研究的能力。
【主要课程】
土木工程材料、工程测量、力学、混凝土结构、钢结构、地基基础、建筑结构抗震与防灾、多高层建筑结构设计、工程概预算、施工技术与管理等。
【就业方向】
可在土木工程领域,尤其是房屋建筑方向的建筑设计院、建筑施工、工程管理等单位从事设计、施工、管理等工作。具有一定工作经验后可参加国家注册结构工程师、注册建造师或注册监理工程师等资格考试。
道路桥梁工程方向：
【培养目标】
本专业培养基础扎实、知识面宽、动手能力强、获得工程师基本训练的高级道路桥梁工程技术人才。具有进行道路桥梁工程设计、施工、试验、管理和研究的能力。
【主要课程】
土木工程材料、工程测量、力学、钢结构、地基基础、路基路面工程、道路勘测设计、桥梁工程施工技术与管理、结构抗震与防灾、工程概预算等。
【就业方向】
能在土木工程领域尤其是道路桥梁方向的市政设计院、市政工程施工、监理等单位从事设计、施工、监理、投资、开发等工作。具有一定工作经验后可参加国家注册结构工程师、注册建造师或注册监理工程师等资格考试。
工程管理专业（本科四年）
本专业设项目管理和造价管理两个专业方向
项目管理方向：
【培养目标】
本专业培养具备土木工程技术与工程管理相关的管理、经济和法律等基本知识，获得工程师的基本训练，能在国内外工程建设领域从事工程项目全过程管理的复合型、应用型高级专门人才。
【主要课程】
工程项目管理、工程经济学、工程估价、工程合同管理、土木工程施工、工程力学、工程结构、运筹学、建筑法规、管理学原理等。
【就业方向】
可在建设工程领域尤其是房屋建筑、市政工程的施工企业、项目管理公司、工程咨询企业、政府相关职能部门从事施工管理、监理、投资、开发等工作。具有一定工作经验后可参加注册建造工程师、注册监理工程师或建设项目管理师等资格考试。
造价管理方向：
【培养目标】
培养具备工程造价专业必需的专业理论知识、技能及造价工程师的基本素质，具有独立应用计算机软件进行工程预算、结算及工程造价计价与控制能力的高级技术应用型人才。
【主要课程】
建筑经济、建筑工程材料、建筑工程施工技术、工程测量、建筑构造、建筑设备、工程力学与结构、定额编制原理、工程造价控制、工程造价计价等。
【就业方向】
可在建筑施工企业、建设监理单位、项目业主方、招投标代理公司、房地产企业以及工程咨询、设计等单位中从事相关的工程造价业务工作。具有一定工作经验后可参加注册造价工程师、注册咨询工程师或建设项目管理师等资格考试。