截至7月23日20时30分，全市2009年普通高校招生本科第二批录取工作基本结束。全国共有390所高等院校在我市共录取新生29548人，其中文科考生9608人、理科考生19940人。经层层筛选和公示后，本科第二批次共录取市属特长生16人。
据统计，在本科第二批录取中，共有26所高校向重庆增加文科计划1325个，11个院校减少计划20个，文科净增计划1305个；共有21个院校在我市增加理科计划1488个，11个院校减少计划34个，理科净增计划1454个。
全市二本批次线上生源充足，考生志愿填报相对均衡。从地域上看，地处市内高校与北京、上海、广东等大城市、东南沿海经济发达地区的高校依然是大多数考生追逐的热门；从院校类别来看，文史类考生偏爱语言类、管理类院校，特别是英语专业相对较热；理工类考生偏爱医学、计算机自动化及土木工程类专业院校。
部分二本院校录取平均分数线高于一本最低控制线。据统计，在二本录取中，南京财经大学、安徽财经大学、上海立信会计学院、上海海事大学、北京信息科技大学、南京审计学院、上海海关学院等７所高校文史类录取平均分高于一本录取控制线；重庆医科大学、重庆交通大学、西南交通大学、西南石油大学、成都理工大学、重庆大学采矿工程专业、广东工业大学、北京信息科技大学、大连医科大学、北京物理学院、解放军理工大学人防专业、上海海关学院等12所院校理科录取平均分高于一本录取控制线。重庆理工大学、重庆工商大学、重庆师范大学等市内院校生源较好，均经一志愿投档后就顺利完成了招生计划。
二次征集志愿效果良好。全市共有9185人参加二次征集志愿，其中文科考生2833人、理科考生6352人，有效志愿考生数为3238人，其中文科考生746人、理科考生2492人。二次征集志愿共录取考生1061人，其中文科考生308人、理科考生753人。志愿征集，确保了招生计划的圆满完成。
在二本批次录取期间，共有29所市外高校在我市降分录取，降分幅度达20分。