贲门肿瘤有一小部分是良性，但部分贲门肿瘤是恶性肿瘤。
良性贲门肿瘤，比如贲门部息肉，炎性息肉和增生性息肉一般是良性，但如果是腺瘤性的息肉就比较容易发生癌变。所以如果发现贲门部肿瘤，不管是良性还是恶性都需要常规活检，送病理化验才可以最终确诊是良性还是恶性。
贲门部位的良性肿瘤特点是生长速度比较缓慢，边界比较清楚，有完整的胞膜，不会出现扩散和淋巴结的转移。而贲门部位的恶性肿瘤特点是生长速度比较快，边界不清楚，有毛刺，没有完整的包膜，容易出现扩散和淋巴结转移。所以一旦发现贲门肿瘤，要立即就诊，以免耽误病情的发展。