打完疫苗晚上发烧39度，正确说法是打完疫苗晚上发烧39摄氏度，可能与不良反应有关，但也不排除上呼吸道感染以及其他疾病所引起的发烧。
1、接种疫苗副反应：接种疫苗后，可能出现不良反应，例如发烧。由于机体对疫苗产生应激反应，可使机体体温升高，一般发烧持续48-72小时左右可自行缓解，通常不需要进行特别的治疗处理。
2、不排除上呼吸道感染导致发烧：若刚好打完疫苗，除了发烧39摄氏度，同时伴随有畏寒、流涕、咳嗽等症状。一般可给予对乙酰氨基酚、布洛芬等解热镇痛药进行治疗。
3、其它疾病导致发烧：机体本身出现免疫缺陷问题，若患者打疫苗后，除了发烧39摄氏度，还会有乏力、皮疹、体重减轻、关节痛等症状。患者可通过锻炼和改善饮食来增强身体免疫力，必要时可遵医嘱使用增强免疫力的药物，如胸腺肽等。
发烧期间可采用温水擦浴、口服退热药等措施来辅助退烧。如果是接种了狂犬病、破伤风杆菌等疫苗后引起的发烧39摄氏度，则应避免使用抗病毒药物，否则可能导致免疫程序失效。