头孢与阿莫西林有一定的相似之处，不存在哪个危害更大，但总的来说，头孢引起的不良反应和药物毒性比阿莫西林小。
阿莫西林属于青霉素类抗生素，头孢的全称是头孢菌素类抗生素，二者同属于β-内酰胺类抗生素，在抗菌机制和药物的化学结构上都有相似之处。从这个层面来说，不存在哪个危害更大的问题，只要对症都是合适的药物。
但是，阿莫西林和头孢菌素又属于两种不同的药物分类，头孢菌素的抗菌谱更广、抗菌作用更强，而且服用后引起患者的过敏反应更少、药物毒性更小。因此，从这一点看也可以认为阿莫西林的危害比头孢菌素要大，但患者不应单纯通过这种比较而自行停药，在接受药物治疗期间应遵医嘱用药。