打疫苗后48小时后发烧有可能是正常的生理反应。也有可能是不正常的疾病因素，需要具体情况具体分析。
疫苗对于人体是一种异种抗原，抗原进入机体后会刺激机体免疫系统产生特异性抗体，当抗原抗体反应后可能会导致机体出现发热的现象。由于个人体质不同，每个人对疫苗的反应时间是不一样的，大部分人在接种疫苗后24-48小时内会发烧，少部分人的发烧会出现在48小时后，通常为低烧，持续时间不会很久。
如果打完疫苗后发烧时间较晚，且出现持续性的发烧，这种情况一般不是疫苗反应造成的，需要考虑合并其他疾病引起的发热，应结合具体发热情况、伴随症状进行具体分析检查及处理。
打疫苗后48小时后出现发烧，不管是哪种原因造成的，建议患者都应及时就医。