肛窦炎最主要的临床症状，主要是以肛门局部不同程度的憋胀下坠感，以及少量分泌物存在，尤其是当急性发作时，患者会在排便以后，会出现肛周局部的脓液或者粘液，随着大便一同排出肛门外，甚至还会伴随有不同程度的刺痛。
治疗肛窦炎主要是以肛管内消炎对症治疗为主，轻度的肛窦炎或者早期肛窦炎患者，可以选择保守用药治疗，可以在医生指导下选择甲硝唑栓剂塞入肛门给药，并且保证治疗期间清淡的饮食和规律的排便，如果肛窦炎出现了反复发作时，为了进一步避免局部肛窦以及肛隐窝，反复感染而诱发肛周脓肿，也可以通过手术将局部感染的肛窦打开去除干净。