理论上，莫沙必利通过促进乙酰胆碱来增加胃动力的药物，对于心脏都是有一点点副作用的，但是非常小，一般吃1-2周时间，副作用率小于千分之一，但根据现有的临床数据反映，莫沙必利对心脏没有不良影响。这种药物它的不良反应主要出现在神经系统，消化系统等方面。莫沙必利它是一种治疗胃肠动力的药物，口服莫沙必利可能会导致出现腹泻，腹痛，口干，便秘等胃肠道副作用。
另外使用莫沙必利还有可能引起头痛，头晕，疲倦等神经症状。对莫沙必利过敏的患者还可以产生皮疹，瘙痒等过敏反应。服用莫沙必利期间，如果出现了转氨酶的升高等肝功能异常的现象，患者应立即停药并及时到当地医疗机构就诊。