小儿肛周脓肿一般可给予药物或手术治疗等。
1、药物治疗
口服药物：小儿出现肛周脓肿时，可在医生指导下口服阿莫西林、头孢克肟等抗生素，能帮助控制感染。对于有排便困难的肛周脓肿患儿，可给予麻仁丸等缓泻剂来软化大便，能减轻排便疼痛症状。
外用药物：小儿肛周脓肿未形成或未切开引流时，可遵医嘱外用红霉素软膏、夫西地酸软膏等，能缓解症状。
2、手术治疗
小儿肛周脓肿症状较为严重时，可予以脓肿切开引流术，能防止感染进一步扩散。对于肛周脓肿并发肛瘘的小儿，可在肛周脓肿痊愈后行肛瘘手术。对于肛周脓肿合并会阴部坏死性筋膜炎的小儿，术后如有新的坏死组织，可给予清创。
小儿肛周脓肿恢复期间，应清淡饮食，保证睡眠充足，注意局部的清洁卫生，以促进小儿肛周脓肿的好转。