单侧腰疼的原因如下：
1、泌尿系统结石或者严重的泌尿系感染，多数是出现腰部的绞痛，敲击时疼痛加重，并且伴有小便的疼痛、灼热甚至尿血。肾结石需要进行碎石治疗，泌尿系统感染常用药物为抗生素，如左氧氟沙星治疗。
2、腰扭伤、小关节紊乱、腰肌劳损、腰背部的筋膜炎、腰椎间盘突出等，均可引起单侧腰痛，这种情况多数是因为久坐、久站、弯腰、重体力劳动，或者长期劳累引起。患者可以选择针灸、理疗等进行治疗，严重的腰椎间盘突出需要手术治疗，如椎间盘后切除术。
3、腰椎的骨折，特别是横突骨折只发生在单侧，疼痛也可能累及到整个腰背部，这种情况多数是因为外力损伤，比如碰到了桌角或者车祸、高处坠落等情况。