灌肠退烧药效一般可持续4-6小时，特殊情况下药效会降低，可能只维持1个小时左右。
灌肠退烧是一种直肠给药的降温方法，药物不经过消化道和肝脏，而是直接经肠黏膜吸收后进入下腔静脉，从而发挥药效。这一直肠给药方式一般比口服药物效果要快，药效发挥的时间较长，其作用较温和、持久、稳定，大多数患者使用这一方式可维持药效4-6小时。
但是，由于药物经肛肠黏膜直接吸收，如患者原有吸收不好或肛肠粘膜受损的情况，则药效会因患者的身体情况出现不同程度的降低，一般其退烧作用大概为1小时左右，随后体温可能会逐渐上升。
建议患者在查明发热的原因后进行针对性用药，尽量不采取灌肠的方式来进行退热治疗，以免反复灌肠损伤肠道粘膜，甚至引起感染。