进口奥美拉唑和国产奥美拉唑基本没有太大区别，只有可能在药效方面存在着少许的差异。药物的药效取决于很多方面，包括了药物在体内的溶出速率，药物在体内的起效时间，药物在体内的停留时间，药物在体内代谢过程，这些与药物的研究细节密切相关。但是因为它们同为奥美拉唑，理论上其主要药物成分应该是没有差别的，所以说它发挥的药理作业也是应该是一样的。
但是由于进口的奥美拉唑为原研品，所以它在细节研究中可能更为透彻，我国的为仿制药，可能一些细节方面没有原研药做得那么好。所以这就造成了它可能在疗效上会有稍许的差异，但是大体方向没有任何区别。