凌晨一两点咳嗽属于夜间咳嗽的表现，原因可能是呼吸道感染、咳嗽变异性哮喘、胃食管反流病、心力衰竭。
1、呼吸道感染：如慢性咽炎、鼻炎等上呼吸道感染的患者出现夜间咳嗽，主要与温度变化有关。当夜间温度比白天低时，容易刺激支气管平滑肌而引起痉挛；支气管炎、肺炎等下呼吸道感染的患者容易因为夜间机体处于休息状态，由于迷走神经比较兴奋，且平躺时支气管分泌物难以排出，也可刺激支气管平滑肌而引起痉挛，从而诱发咳嗽。
2、咳嗽变异性哮喘：若病情控制不佳，在夜间可由于迷走神经的张力增高，或夜间低温刺激，患者可能在凌晨一两点时出现咳嗽。
3、胃食管反流病：胃内容物经常出现反流，若患者夜间睡着后反流物刺激到气管，也可诱发咳嗽症状。
4、心力衰竭：如左心衰患者在夜间平卧时，由于回心血量增多而加剧肺淤血现象，在夜间可出现咳嗽，且通常比白天咳嗽更为严重。