重症肌无力吞咽困难并没有所谓的最有效办法，应针对重症肌无力进行治疗，包括药物治疗和手术治疗。
一、药物治疗
1、胆碱酯酶抑制剂：如溴吡斯的明、新斯的明等，应遵医嘱从小剂量开始，用药间隔时间尽可能延长，可以改善肌无力的症状。
2、糖皮质激素：如甲泼尼龙、醋酸泼尼松、醋酸泼尼松龙等，若病情危重，可用糖皮质激素冲击治疗。
3、免疫抑制剂：如硫唑嘌呤、环磷酰胺、环孢素A、他克莫司等，可调节自身免疫功能，缓解重症肌无力的临床症状。
二、手术治疗
另外，大部分重症肌无力的患者可能患有胸腺瘤，对于可疑胸腺瘤的患者应尽早行胸腺手术。对于胸腺瘤不能手术切除者，尤其是对药物治疗反应不好的患者，可采用胸腺放射性治疗。