怀孕三个月进行药物流产，失败率是比较高的。药物流产一般需要在停经49天之内进行，怀孕三个月时，胚胎发育过大，并且已经出现骨骼分化，这个时候是不适合进行药流的。如果服用药物流产，什么时候可以排出胚胎与患者对药物的敏感程度相关。药流最后一次服药后患者会出现剧烈的宫缩，一般2~6个小时会排出孕囊。药流后如果出血量超过了平时的月经量，或者阴道出血的时间过长，应当及时进行超声检查，考虑有流产不全或者感染的可能，如果流产不全，可能需要进行清宫手术。
药流后如何促进身体恢复
药流后子宫内膜会有一定的损伤，并且需要一段时间来修复，需要注意观察子宫出血的情况，注意个人卫生，洗澡时尽量选择淋浴。如果流产后阴道出血时间过长，或者出现有异味、发热等症状，要及时就诊。药流后需要补充营养，可以多吃一些豆制品、瘦肉、鱼类等蛋白质含量丰富的食物，促进身体恢复。可以遵循医嘱服用有助于子宫内膜恢复的药物。
流产后要注意多休息，避免劳累，注意保暖，不要着凉。由于卵巢和子宫都处于恢复阶段，所以在流产后一个月内要避免性生活，同房后要做好避孕措施，最好半年后再怀孕。