肛门闭锁主要以手术治疗为主，肛门闭锁也称为肛膜闭锁、肛门直肠畸形，是指的新生儿直肠肛门完全闭合，无法排出粪便的一种先天性直肠肛门疾病，患有该疾病后患儿需要立即接受手术。肛门闭锁病因比较复杂，考虑与家族基因有关，即遗传相关的因素，基因突变会引起肛门闭锁，胚胎在延伸的过程中，如果母体受到射线的辐射或者有毒、有害物质的侵害、刺激，就可能会导致直肠的延伸在中途停止，从而导致肛门没有形成，出生后会出现肛门闭锁。
肛门闭锁治疗方法
1、肛门扩张术，适用于肛门狭窄。根据狭窄开，口大小选用合适扩肛器扩张肛门。
2、对于生后没有扩肛，或肛门开口极其狭小者，可选用会阴肛门成形术。
3、会阴肛门成形成术一般须在生后1~2 天内完成手术，直肠前庭瘘因瘘孔较大，在一段时间内尚能维持正常排便，可于3~6个月以后进行手术。
4、后矢状入路肛门直肠成形术，原则上应先行结肠造瘘，1 个月后根据患儿情况行根治手术。
5、腹腔镜辅助下骶会阴直肠肛门成形术，不开腹，术后括约肌在新肛门周围形成较为有力的、对称性收缩，提高术后排便控制能力，是一种治疗高、中位肛门直肠畸形新的手术方式。
6、泄殖腔畸形的治疗，出生后应立即进行结肠造瘘术，治疗时间根据患儿情况、畸形复杂程度及术者的经验而定。
肛门闭锁的症状以及注意事项
1、后可以进行肛门的局部锻炼有助于减少术后并发症，对改善肛门的生理功能有很大帮助。
2、在患儿无法配合康复锻炼的情况下，可以物理治疗。