脑起搏器是一种新型的治疗手段，高度的安全性是一大优点，很少有永久性副作用，极少数患者感觉肌力减弱、说话音调降低、一过性头晕和一过性麻木感，如果出现这些副作用，可以通过体外程控而减轻或消除。临床上，脑起搏器手术的副作用主要是出血。因为在插入刺激器电极的时候，不是在直视下做的，所以容易引起出血。如果治疗的位置不对，则可能引起偏瘫、失语等神经功能缺失的症状。而且如果病人自身不愿意接受这种治疗，顺应性就会较差，治疗效果也就很差。
帕金森患者脑起搏器手术的效果由什么因素决定
1、病人的选择即适应症的选择，一定要选择原发性帕金森病；
2、手术时机的选择，一定要选择药物出现开关症状并且出现异动症时来做手术，部分病人不一定有异动症，但至少要等病人有明显的开关症状时做手术，病人就会有很好的效果；
3、手术靶点的选择，手术靶点分为丘脑底核和苍白球两个靶点，不同症状有不同的适应靶点。对于外科来说，最重要的是要把脑起搏器两根电极准确的埋植在选择靶点的位置，该步骤非常重要，如果偏差＞2mm，手术可能完全没有效果，甚至还会带来相应并发症，患者会出现不舒服的症状；
4、术后通过良好的程控参数来把控病情，对病人症状的改善有所帮助。