两岁宝宝体温达到39摄氏度，需要综合应用物理降温和退烧药一起治疗。物理降温主要包括温水擦拭和退烧贴，同时减少宝宝穿衣数量，以避免穿得太多导致散热障碍出现惊厥，多让宝宝喝水，以补充发烧导致的水分流失。对于四肢发冷、嗜睡、精神反应不佳的宝宝，应及时就医，由儿科医师诊治。
两岁宝宝高烧39度以上怎么办：
1、多喂温开水、蔬菜水和果汁。给宝宝充足的水，这不但能降低宝宝身体的温度，还能防止宝宝脱水，非常有效实用，但是这个时候给宝宝喂食的水应以温热为宜，因为宝宝发烧经常伴随着肠胃症状和咳嗽，冷水会加重这些症状。
2、用温水擦浴，即用温毛巾擦拭宝宝全身，这是一个很好的降温方法，适合所有发烧的宝宝，每次擦拭10分钟以上，重点擦拭颈部、腋窝、肘部、腹股沟等。
两岁宝宝高烧39度以上要注意什么：
当宝宝发烧39度时，已经属于高烧。如果宝宝的脸色与往常无异或者只有微微的潮红，家长可以暂时在家照顾，但是宝宝如果面色暗淡、发紫，眼睛迷糊，就表示病情比较严重，这个时候家长不应盲目退烧，应及时去医院找出宝宝发烧的原因，并根据病因进行对应的治疗。因为发烧是身体的一种正常防御反应，着凉、白血病等很多疾病都出现发烧的症状。