肛瘘形成后不能自愈，就需采用手术治疗。对于一些复杂性或者复发性肛瘘，如明确合并有结核、克罗恩病、放线菌病及性病时，需积极治疗合并的疾病，否则仅用手术不易治愈。肛瘘手术后会产生一些并发症，如肛周疼痛、坠胀感等。但这些并发症在积极治疗下是可以缓解的。
肛瘘手术后有哪些并发症？
肛瘘形成后进行手术是必须的，但是肛瘘手术术后，有可能发生并发症和术后的不适。 第一个并发症就要考虑有没有发生肛门的失禁，因为很多肛瘘的瘘管有可能跨过肛门的括约肌，如果治疗的时候，损伤了肛门的括约肌，可能导致肛门失禁。但只要手术是规范的，医生是正规训练出来的，发生这样的机会还是比较少的。
因为跨过肛门括约肌，有不同的处理的方式，其次就是肛门肛瘘术后的不舒服，比如肛门周围的疼痛，局部的肿胀坠胀不适，这些都可以通过药物的治疗可以缓解，综上所说肛瘘的手术还是利大于弊的。
肛瘘手术后如何减轻缩肛？
肛瘘手术之后因为疼痛不适或者是挂线，这些处理导致肛门的受到一定的刺激，所以会出现肛门一阵一阵收缩，这种不适的情况。 如果出现这种情况，都有一些治疗的措施。第一个就是可以应用止痛的药物，疼痛的减轻了之后这种反应的就会减少。
另外就是排便之后，可能会有分泌物刺激切口，所以排便之后用温水坐浴，就是说放半盆温水，把屁股创面这些地方泡到温水里面，泡五到十分钟。温水可以达到一种清洁和理疗的效果，可以减轻这种不适感。另外如果是创面的敷料 还有内裤，如果被这些分泌物污染要及时更换，减少分泌物的刺激，肛门这种收缩的情况的也可以减轻。
肛瘘手术会留下一些轻微的并发症，这些并发症在药物治疗下能够解除，并不会对生活造成影响，患者行肛瘘手术利大于弊，只有通过手术，才能治愈肛瘘。