目前推荐低风险的孕妇在20-23周之间作胎儿超声筛查先心病，而高风险的孕妇则在12-14周。胎儿超声心动图是应用医用超声成像技术在母亲怀孕期间对胎儿心脏的位置、结构、血流和功能进行系统的专项检查和评估。
当可以选择终止妊娠时，诊断越早对孕妇越好，可以使痛苦减到最小。然而妊娠早期胎儿心脏体积小，超声图像清晰度欠佳，诊断准确响，且胎儿心脏是动态发育过程，一些早期不明显，但是会随孕期的推移进行性发展的先天性心脏病无法在早期检出。因此，妊娠早期超声心动图检查只适用于高危胎儿，常需要至18-24周时复查，以提高胎儿心脏畸形显示率和精确性。
胚胎发育到第二周开始形成原始血管，第三周形成原始心血管系统并具有血液循环，第7~8周心房心室形成，胎儿心脏结构基本完成。所以，在这个时期胎儿受到外界任何刺激都会影响胎儿心血管发育。但是早期胎儿心脏小，切面显示不清;晚期胎儿骨骼发育后方声影影响及胎方位的影响均导致胎儿心脏的探查受影响。一般认为：孕期22-28周是进行胎儿超声心动图检查的最佳时间。
在妊娠18～24周时，胎儿心脏发育已逐渐趋向完善，心内结构显示清晰，且胎儿活动度大，羊水量多，各种切面的显示率可达100％ ，故在此时进行超声心动图检查最佳。
妊娠晚期检查时，由于羊水减少，胎儿较大，体位相对固定，且枕前位居多，透声窗较差，声束容易受胎儿脊柱及肋骨声影影响而难以显示清晰的图像，检查效果较差。