怀孕孕酮数值3.9属于太低了，能保住的可能性是很小的.，也可能有宫外孕或者先兆流产的风险的，孕酮低的话，还可能会导致胚胎不能继续发育而导致流产。你现在首先要去医院做个检查确定是宫内孕还是宫外孕。如果确定是宫内孕的话，孩子还是可以保住的，但是要积极做检查注意胎儿的动向，观察孕酮的数据变化。积极到医院做个超声检查,要记住定期复查，平时要多注意观察胎儿的发育情况，积极听医生的。而且要积极治疗，打保胎针，针剂效果要好很多，最好别活动！保住胎后前三个月也不能提重物和干重活的，千万不要过夫妻生活！你这情况建议在医生指导下保胎治疗的，注意做好复查，禁止性生活，卧床休息。
治疗孕酮低常用的药物是黄体酮等，具体的你可以结合你的情况在主治医生的指导下用药治疗。日常生活中，应该选择那些植物性雌激素较为丰富的食品。植物性雌激素广泛存在于豆类、谷类、水果、蔬菜等食品中，不仅易得而且安全，引起孕酮低的原因是一些疾病导致黄体功能不全，或是分泌不够。如果有阴道出血、腹部疼痛、下坠的感觉，建议去医院肌注黄体酮，一周后进行复查。可以做b超检查或者HCG检查。
而且如果是宫外孕的话，胎儿保住的可能性就很小了，建议做保守治疗。如果你确定是宫外孕的话一定要进行及时的治疗,以防对身体造成伤害.如果发现早的话,在输卵管受损前宫外孕可以使用药物治疗.而且你孕酮那么低，是非常难的。通过药物就可以避免手术,但是可能会有副作用的。