怀孕6周肚子疼的原因一：生理性腹痛
怀孕初期会因子宫扩大，加上子宫的韧带受到拉扯，而常引起下腹不适，甚至刺痛，都是孕期正常的生理症状，不需要特别治疗，它会随着身体逐渐适应而缓解。
2怀孕6周肚子疼的原因二：妊娠并发症
怀孕6周的孕妇肚子疼的同时，还伴有见红、出血、发烧、寒战、阴道分泌物、触痛和疼痛，或者，或者休息几分钟之后，疼痛仍然没能缓解，特别是下腹部疼痛，则很有可能是妊娠并发症，常见的有先兆流产或宫外孕，此时应该尽早感到医院进行检查和治疗。
3怀孕6周肚子疼的原因三：妇科炎症疾病
如果准妈妈没有做过孕前检查，不知道自己是否有妇科病，怀孕6周常肚子疼，不排除妇科炎症疾病的可能，准妈妈应该到妇产科B超检查排除下。
4怀孕6周肚子疼的原因四：胃肠道疾病
怀孕6周的孕妇肚子疼可能是胃肠道疾病，比如肠炎、阑尾炎，应该及时的进行进行孕检，主要是排除胎儿缺氧等问题，再就是自身的血压等情况，是否有腹泻等肠炎疾病。及时的进行诊治，自己要重视但不要太紧张了。
5怀孕6周肚子疼的原因五：卵巢肿瘤
怀孕期间，伴随有卵巢肿瘤的并发症也相当常见，这些并发症包括肿瘤扭转及肿瘤破裂等，从而导致腹痛和阴道流血的情况出现，因此一旦有绞痛、腹部不适、腹部异常膨大、腹水等情况发生时，必须尽快就医。
6如何区分怀孕6周是不是生理性腹痛
生理性腹痛的疼痛的位置并不固定，有时在左下腹，有时则在右下腹，疼痛时间持续很短。如果孕妇痛疼比较明显和难忍，则应该马上到医院检查治疗。