物理、化学和生物因素均可能影响胎儿发育。对孕妇和胎儿有影响的常见有毒有害物质包括铅、汞（水银）、砷、苯、甲苯、二硫化碳、氯乙烯、麻醉性气体等。含有这些物质的物品随处可见，如油漆、塑料、橡胶、工业胶水、皮革、汽油、农药等。另外列举一些情况如下：
1、孕妇身体肥胖：容易发生新陈代谢异常，导致胚胎的神经系统发育出现畸变。叶酸是保证胎儿神经系统发育的重要营养，有助于减少神经管畸形儿的发生。但对于身体肥胖的孕妇，叶酸很难在他们身上发挥这样的保护作用。美国一份资料显示，孕前体重超重的女性，产下神经管畸形儿的几率是正常者的2倍；孕后体重超重的女性，产下神经管畸形儿的几率是体重正常者的4倍。孕前就要开始摄取充足的叶酸，包括安排富含叶酸的食物，如动物肝或肾、绿色蔬菜、鱼类、蛋类、谷类及豆制品等；同时从孕前1~3个月开始服用叶酸补充剂，一直到分娩后为止。
2、孕妇患牙周炎：患中度或重度牙周炎的孕妇，其体内的细菌抗原容易通过血液循环进入胎盘，使胎儿受到感染，导致其出生后患先天性心脏病、出生时低体重或早产。而且，有轻微牙病的孕妇生出低体重儿的危险性也会增加6~8倍。美国对早产儿的一项调查表明，大多早产儿的母亲体内都有细菌抗原，而足月出生的婴儿母亲却没有这种现象，牙周炎孕妇发生早产的几率是正常孕妇的7倍。患牙周炎的孕妇要积极治疗，准备怀孕的女性应在孕前就做牙科检查。
3、孕期缺碘：容易影响甲状腺素合成，导致胎儿出生后患呆小病。孕妇体内缺碘后，将会影响体内的甲状腺激素合成，造成胎儿大脑在发育时主管听觉和智力的皮质不能完全分化，导致出生后患“呆小病”，表现为生长缓慢、反应迟钝，并出现头大、鼻梁下陷、舌外伸、流涎的特殊面容，成年后身材矮小，甚至出现聋哑、精神失常等，而现今对于呆小病尚无特效治疗方法。孕期要注意均衡地摄取营养，特别是生活在缺碘地区的孕妇更要注意摄取富碘食物，坚持食用碘盐，使体内的碘能满足胎儿的生长发育要求。
4、孕期缺铜：容易影响胎儿体内的铁质吸收和运转，使胎儿发生贫血。孕妇血液中的铜含量过低时，会造成胎儿体内缺铜，影响胎儿新陈代谢中有些酶的活性及铁的吸收、运转，造成胎儿贫血。因此，孕期不可忽视对铜的摄取，一定注意补铜。以免对胎儿健康造成严重影响。补铜的途径以食补为主，富含铜的食物为动物肝、肉类（尤其是家禽）、水果、硬壳果、西红柿、青豌豆、马铃薯、贝类、蔬菜、可可及巧克力等。
5、孕期缺锰：容易影响胎儿的骨骼生长发育，发生关节变形。孕期缺锰会引起胎儿发生多种畸变，特别是严重地影响骨骼发育，出现关节重度变形，所以孕期一定要注意摄取锰。一般来讲，如果孕妇以谷类和蔬菜为主食通常不会发生缺锰，但要是经常吃加工得过于精细的食物或总以乳品、肉类为主食，则会造成体内缺锰。孕期要注意均衡饮食营养素，同时多吃一些水果、蔬菜和粗粮。
6、孕期缺铁：容易使胎儿的生长发育收到阻碍，导致出生后体重过轻。铁是血红蛋白的主要组成成分，孕妇缺铁会影响血红蛋白把氧气和营养物质携带到胎儿的组织细胞里，影响胎儿的新陈代谢，容易使胎儿发生缺铁性贫血，还会阻碍胎儿的生长发育速度，使胎儿出生后体重过轻。孕期5个月后，注意从饮食上摄取富含铁的食物。